Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms