Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms