Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms