Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tm4sf1Q64302 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tm4sf1Q64302 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tm4sf1Q64302 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tm4sf1Q64302 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tm4sf1Q64302 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tm4sf1Q64302 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tm4sf1Q64302 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tm4sf1Q64302 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm4sf1Q64302 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms