Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm5dQ62240 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms