Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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