Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms