Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm29609Q3UU56 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm29609Q3UU56 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm29609Q3UU56 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm29609Q3UU56 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm29609Q3UU56 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm29609Q3UU56 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm29609Q3UU56 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm29609Q3UU56 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm29609Q3UU56 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm29609Q3UU56 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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