Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx27Q3UHD6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snx27Q3UHD6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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