Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Otud5Q3U2S4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Otud5Q3U2S4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Otud5Q3U2S4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Otud5Q3U2S4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otud5Q3U2S4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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