Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms