Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpgp1Q3TLS3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms