Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edem3Q2HXL6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms