Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms