Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab42Q0PD08 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms