Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms