Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cdx4Q07424 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms