Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms