Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai1Q02085 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms