Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3aP97351 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms