Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irx1P81068 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 817.8 ms