Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx3P81067 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms