Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms