Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psen1P49769 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Psen1P49769 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms