Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdc2P43407 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms