Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc1P34928 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms