Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Saa4P31532 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Saa4P31532 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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