Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk4P30285 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk4P30285 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms