Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrbP28704 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrbP28704 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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