Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms