Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna9P09235 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms