Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms