Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Opn1mwO35599 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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