Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ptpn9O35239 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptpn9O35239 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms