Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Eftud2O08810 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms