Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21900J3QP38 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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