Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms