Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap11-1E9Q2E9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms