Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms