Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mterf1bB9EJ57 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms