Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms