Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms