Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gpc6Q9R087 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gpc6Q9R087 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gpc6Q9R087 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gpc6Q9R087 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gpc6Q9R087 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gpc6Q9R087 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gpc6Q9R087 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gpc6Q9R087 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gpc6Q9R087 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gpc6Q9R087 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gpc6Q9R087 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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