Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1fQ9JIS7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms