Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubiad1Q9DC60 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubiad1Q9DC60 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubiad1Q9DC60 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubiad1Q9DC60 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubiad1Q9DC60 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubiad1Q9DC60 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubiad1Q9DC60 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubiad1Q9DC60 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubiad1Q9DC60 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms