Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tspan13Q9D8C2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms