Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms