Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms