Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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