Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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